فصلنامه علمی- پژوهشی علوم پیراپزشکی وتوانبخشی

فصلنامه علمی- پژوهشی علوم پیراپزشکی وتوانبخشی

بررسی پلی‌مورفیسم ژنومی و ساختار کلونال Acinetobacter baumannii بالینی و ارزیابی ارتباط اپیدمیولوژیکی و پلی مورفیسم آن با روش MLVA

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان
1 کارشناسی ارشد گروه زیست شناسی سلولی و مولکولی، واحد سیرجان، دانشگاه آزاد اسلامی، سیرجان، ایران
2 استادیار گروه میکروبیولوژی، واحد سیرجان، دانشگاه آزاد اسلامی، سیرجان، ایران
3 دکترای حرفه ای دامپزشکی، گروه دامپزشکی، دانشگاه شهید باهنر، کرمان، ایران
4 کارشناس ارشد میکروبیولوژی، عضو انجمن علمی میکروب شناسی ایران، تهران، ایران
5 دانش‌آموخته کارشناس ارشد میکروبیولوژی، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه شاهد، تهران، ایران
6 دکترای حرفه ای دامپزشکی، گروه دامپزشکی ، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد بافت، کرمان، ایران
چکیده
هدف:
اسینتوباکتربومانی کوکوباسیلی گرم منفی است که به عنوان عامل پاتوژن طیف وسیعی از عفونتهای بیمارستانی مطرح می باشد. تعیین تایپ مولکولی می تواند سویه‌های باکتریایی مشکوک و سریع الرشد را از شیوع جدی آن متمایز کند. MLVAروش تایپ مولکولی برای زیرگروه بندی جدایه های میکروبی بر اساس تعداد کپی متغیر وتعداد تکرارهای پشت سرهم است. لذا هدف از این مطالعه بررسی پلی‌مورفیسم‌ ژنومی از اسینتوباکتر بومانی جدا شده از نمونه‌های بالینی با روشMLVA می‌باشد.
روش بررسی:
در این مطالعه تعداد 60 جدایه اسینتوباکتربومانی از منابع بالینی جمع آوری گردیده، از آزمایشگاه میکروبیولوژی پاسارگارد اخذ شد. رنگ آمیزی گرم و تست های بیوشیمیایی برای تایید بانک میکروبی انجام شد و DNA ژنومی جدایه‌ها با استفاده از کیت، استخراج گردید. آزمون PCR به منظور شناسایی نواحی توالی های تکرار و با هفت جفت پرایمر انجام شد. پس از جمع آوری داده‌ها و الکتروفورز، درخت فیلوژنتیک با نرم افزار PHYLOViZ ترسیم گردید. سطح معنی داری P<0.05 با استفاده از نرم افزار SPSS 22 در نظرگرفته شد.
یافته ها:
ازبین 60 جدایه مطالعه، 9 کلاستر بدست آمد که کلاسترA وC دارای بیشترین عضو (هرکدام دارای 9 عضو) و متنوع ترین کلاید بود. در این بررسی 6 کلونال کمپلکس (CC) بدست آمدکه CCVI دارای بیشترین تنوع سویه‌ها بودند. براساس شاخص سیمپسون و اندکس شانوس هرچقدر شاخص تنوع به عدد یک نزدیکتر باشد آن مارکر برای تفکیک جدایه‌ها بهتر است. تنوع ژنتیکی هر یک از چهارمارکر نشان دهنده اینست که مارکر Ms-07 و Ms-23 با شاخص سیمپسون 0/9 و آنتروپی شانوس 3/4 برترین مارکر درتفکیک 60 جدایه اسینتوباکتر بومانی بدست آمد.
نتیجه گیری:
دودمان متنوع اسینتوباکتر بومانی درمطالعه حاضر نیاز به طراحی برنامه نظارتی کافی براساس کلون اصلی درگردش و انتخاب درمان مناسب را برجسته می‌کند. بررسی و پیگیری مستمر دودمان های مختلف برای یافتن الگوهای مقاومت آنتی بیوتیکی توصیه می‌شود. با توجه به مقاومت رو به رشد در اسینتوباکتر بومانی کنترل و نظارت بر مصرف دارودرمانی عفونت های اسینتوباکتر بومانی به منظور کنترل شیوع مقاومتهای جدید را باید درنظر بگیرند.
کلیدواژه‌ها
موضوعات